מחקרים

הקשר בין מחיקות גנומיות מזעריות והתפתחותה של אפילפסיה

החוקרים מצאו כי למחיקות גנומיות מזעריות ישנה השפעה הטרוגנית על התפתחותה של אפילפסיה כללית גנטית ותפקיד שולי בהתפתחות של אפילפסיה רולנדית ואלפסיה פוקלית בבגרות

בדיקה גנטית (צילום: אילוסטרציה)

מחיקות גנומיות מזעריות (microdeletions) ידועות כמעלות סיכון לאפילפסיה, ובמיוחד באזורים "חמים" של שחלוף גנטי. עם זאת, מידת ההשפעה של מחיקות שאינן באזורים אלו משתנה בסוגי אפילפסיה שונים ולא נחקרה היטב.

החוקרים ביקשו לבחון את השפעתן של מחיקות גנומיות זעירות מחוץ לאזורים "חמים" על סוגי אפילפסיה שונים. החוקרים העריכו את ה"נטל", תדירות והרכב של מחיקות גנומיות מזעריות גדולות אשר נמצאו בעוקבה של 1,366 חולים עם אפילפסיה כללית גנטית (GGE) ובנוסף, מחיקות נוספות שטרם פורסמו ונמצאו ב-281 חולים עם אפילפסיה רולנדית (RE) ו-807 חולים עם אפילפסיה פוקלית של הבגרות (AFE). מחיקות הוערכו בגישה כוללת וספציפית ב-2,454 חולים ו-6,764 מקרי ביקורת.

כאשר לוקחים בחשבון נקודות "חמות", החוקרים זיהו העשרה של מחיקות באנליזת האפילפסיה המשולבת (יחס סיכויים 1.90; רווח בר-סמך 95% 1.51-2.35; p=1.06X10^-6). אנליזה של סוגי אפילפסיה ספציפיים הדגימה כי מחיקות בנקודות "חמות" בקבוצת ה-GGE תורמות את רוב הסיגנל (יחס סיכויים 7.45; 4.20-13.5; p=9.79X10^-12). מחוץ לנקודות "חמות" מחיקות היו מועשרות בקבוצת ה-GGE בגנים נוירו-התפתחותיים (יחס סיכויים 2.85; 1.62-4.94; p=9.13X10^-3). לא נצפה סיגנל נוסף עבור RE ו-AFE. עם זאת, אנליזת תכולת גנים זיהתה גנים מועמדים ידועים (NRXN1, RBFOX1, PCDH7) וחדשים (LOC102723362) בסוגי האפילפסיה השונים שלא נמחקו במשתתפי הביקורת.

מסקנת החוקרים היא כי למחיקות גנומיות מזעריות ישנה השפעה הטרוגנית על התפתחותה של אפילפסיה כללית גנטית ותפקיד שולי בהתפתחות של אפילפסיה רולנדית ואלפסיה פוקלית בבגרות.

מקור:

Perez-Palma, E. et al. (2017) Journal of Medical Genetics. 54(9).

נושאים קשורים:  מחקרים,  מחיקות גנומיות מזעריות,  אפילפסיה,  אפילפסיה רולנדית
תגובות